Заказник был организован на месте охотничьих угодий в 1981 г. для восстановления численности видов охотничьей фауны, в первую очередь соболя, марала, а также для сохранения кедровых массивов в бассейне Малой Сумульты, имеющих рекреационное, климаторегулирующее, почвозащитное и водорегулирующее значение для бассейна средней Катуни.
Заказник находится в центре Республики Алтай на территории Онгудайского административного района.
В его пределах преобладают сильно расчлененные среднегорные массивы хребтов Сумультинского, Иолго и Куминского. Абсолютные отметки располагаются на высоте более 2300-2700 м. Хребты образованы во время древней (каледонской) складчатости, их основание сложено гранитами, чередующиеся со сланцами и известняками.
Рельеф складчато-глыбовый, в котором типичное среднегорье сменяется поверхностями выветривания. Встречаются следы древнего оледенения.
Климат континентального типа, смягченный в долине р.Катунь местными ветрами-фенами. Средняя температура января от -14оС до -16оС, июля +18оС. Годовое количество осадков 450-1000 мм. Основные реки: Катунь, Кадрин, Сумульта, питающиеся снежно-дождевыми и частично грунтовыми водами (20-25%). Озера Аккель, Ситен-Кель и другие - регуляторы стока рек. В высотном диапазоне почв выделяются черноземы выщелоченные, оподзоленные, серые лесные, горно-тундровые почвы.
Растительность заказника достаточно разнообразна и подчинена основной закономерности распределения растительных сообществ в любом горном районе - высотной поясности.
Степной пояс на его территории представлен фрагментарно. Здесь развиваются злаковые степи, в которых преобладают тонконог гребенчатый, мятлик степной, ковыль волосатик.
Лесостепной пояс выделен условно, и его растительность носит переходный характер между соседними с ним лесным и степным поясами. Это отражается не только в сочетании степей и лесов, но и в образовании качественно новых сообществ: остепненных лугов с мятликом узколистным, тимофеевкой степной и др.; луговых степей с овсецом пушистым, ковылем сибирским, осокой стоповидной и др.; остепненных лесов с подобным набором видов травостоя.
Лесная растительность занимает ведущее положение и относится к трем классам формаций: светлохвойных, темнохвойных и лиственных лесов. Последние представлены в низкогорье и по долинам рек, где они занимают небольшие площади. Среди светло-хвойных лесов - сосновые (с сосной сибирской) встречаются на нижних уровнях гор. Это самые южные форпосты сосновых лесов в Горном Алтае (в долине реки Большая Сумульта). Здесь сосна, на фоне господствующей лиственницы, образует небольшие островки, приуроченные к выходам скал.
Темнохвойные леса отмечаются фрагментами в полосе лесного пояса в местах с наиболее теплым и влажным климатом. Для них характерно наличие пихты, ели и кедра; кустарников: жимолости алтайской, рябины, шиповника. В травостое встречаются бор развесистый, перловник поникающий, линнея северная, кислица обыкновенная, скерда сибирская, вероника длиннолистая, грушанка и др.
Кедровые леса занимают лишь верхнюю часть лесного пояса и представлены в сочетании с мохово-кустарниковой, разнотравной и ерниковой растительностью. Большие площади заняты парковыми лиственничниками с развитым травяным покровом и кедрово-лиственничные леса с подлеском из жимолости алтайской и круглолистной березки.
Разнообразие растительности высокогорий невелико. Границу леса образует кедр в смеси с лиственницей, иногда с пихтой. В этих редколесьях травяной покров субальпийско-лугового типа с доминированием крупнотравья и изредка зарослями рапонтикума (маральего корня). Небольшие площади занимают альпийские луга с водосбором железистым, купальницей азиатской, фиалкой алтайской, змееголовником алтайским и др. Выровненные вершины занимают ерниковые тундры с березкой круглолистной, реже мохово-лишайниковые.
Во флоре охраняемой территории выражены лесные и высокогорные черты. Эндемиков немного, они представлены широко распространенными видами.
Особого внимания на территории заказника заслуживают виды растений, среди которых есть лекарственные, например, копеечник чайный или красный корень, маралий корень, родиола розовая или золотой корень; пищевые: лук алтайский, кандык сибирский; декоративные: венерин башмачок крупноцветковый.
Все они включены в Красную книгу Республики Алтай (растения). При дальнейших исследованиях на территории заказника вероятны находки многих видов растений, представляющих интерес для науки, нуждающихся в охране или в восстановлении запасов.
Животный мир Сумультинского заказника богат в основном лесными охотничье-промысловыми видами. Здесь много бурого медведя, есть волк, росомаха, барсук, рысь, много соболя и белки, высока численность копытных зверей: марала, косули, кабарги. Водится лось. Появился ранее отсутствовавший на Алтае кабан. На крутосклонном скальном правобережье реки Кадрин обитают сибирские горные козлы. На рыбных реках много американской норки. Из птиц отряда курообразных в тайге особенно много рябчика, есть глухарь, тетерев, в горной тундре много белой и тундряной куропаток. Реки изобилуют хариусом, водятся здесь таймень и налим. Видов, внесенных в Красную книгу Республики Алтай, немного. Из рыб -это ускуч, из птиц отмечались скопа, беркут, балобан, степная пустельга и журавль-красавка, из млекопитающих - речная выдра, известны заходы снежного барса.
Функция Сумультинского республиканского комплексного заказника, как и у Шавлинского - сохранение биологического разнообразия в местах концентрации ценных видов растительного и животного мира для обогащения ими соседних территорий.