Система простейших:

Тип Sarcomastigophora

Подтип Mastigophora

Отряды: С ryptomonadida, Dinoflagellata, Euglenida, Chrysomonadina, Heteroclorida, Chloromonadina, Volvocida, Prasinomonadida, Silicoflagellida.

Класс Zoomastigophorea

Отряды: Сhoanoflagellida, Kinetoplastida, Proteromonadida, Retortamonadida, Diplomonadida, Oxymonadida, Trichomonadida, Hypermastigida.

Подтип Opalinata

Класс Opalinatea

Oтряд Opalinida: Opalina, Zelleriella, Cepedea.

Подтип Sarcodina

Класс Lobosea

Подкласс Gymnamoebia

Отряд Amoebida, Schizopyrenida,Pelobiontida.

Подкласс Testacealobosia

Отряд Arcellinida, Trichosida.

Класс Acarpomyxea, Acrasea, Plasmodiophorea, Eumycetozoea, Filosea

Класс Granuloreticulosea

Отряд Athalamida, Monothalamida, Foraminiferida.

Надкласс Actinopoda

Класс Acantcharea, Polycystinea, Phaeodarea,

Класс Heliozoea